diff --git a/B03_FileInput/B03_FileInput_Router.py b/B03_FileInput/B03_FileInput_Router.py
index 2af94831..76956605 100644
--- a/B03_FileInput/B03_FileInput_Router.py
+++ b/B03_FileInput/B03_FileInput_Router.py
@@ -22,6 +22,7 @@ from B03_FileInput.B03_FileInput_Repository import (
     get_project_storage_relative_path,
     list_incomplete_upload_sessions,
     list_project_input_files,
+    supersede_previous_input_files,
 )
 
 # 분리 전 이 파일에 있던 이름은 그대로 다시 내보낸다 — 옛 이름을 참조하는
@@ -112,6 +113,7 @@ from common_util.common_util_storage import resolve_stored_project_path
 from common_util.common_util_workflow import load_project_workflow
 from common_util.common_util_workflow_state import (
     get_workflow_state,
+    is_analysis_running,
 )
 from config.config_db import get_db_pool
 from config.config_system import (
@@ -199,6 +201,14 @@ async def upload_project_files(
         async with pool.acquire() as connection:
             stored_path = await get_project_storage_relative_path(connection, project_id)
             project_root = Path(resolve_stored_project_path(stored_path))
+            # 분석이 도는 중이면 새 자료를 받지 않는다 — 청크·임시배치 경로와 같은 가드다
+            # (2026-09-08). 이 갈래만 빠져 있어 분석 2개가 같은 산출물 경로에서 부딪혔다.
+            async with connection.cursor(aiomysql.DictCursor) as cursor:
+                if await is_analysis_running(cursor, str(project_id)):
+                    return JSONResponse(
+                        status_code=409,
+                        content={"status": "error", "message": _ANALYSIS_RUNNING_MESSAGE},
+                    )
 
             await connection.begin()
             try:
@@ -229,6 +239,14 @@ async def upload_project_files(
                         crs_epsg=int(crs_epsg) if crs_epsg is not None else None,
                         metadata=metadata,
                     )
+                    # 같은 이름의 옛 행은 내려 둔다 — 청크 경로와 같은 처리다(2026-09-08).
+                    # 이 갈래만 빠져 있어 같은 파일이 두 줄로 활성으로 남았다.
+                    await supersede_previous_input_files(
+                        connection,
+                        project_id,
+                        descriptor.original_filename,
+                        input_file_id,
+                    )
                     results.append(
                         UploadedFileResult(
                             input_file_id=input_file_id,